Lavans-lès-Saint-Claude est située au sud de la région Bourgogne Franche-Comté, au cœur du Parc Naturel Régional du Haut-Jura, à moins de 20 km de la ville sous-préfecture de Saint-Claude. D’une altitude moyenne de 500 mètres, elle s’étage de la vallée de la Bienne au lieu dit « Porte Sachet » (356 mètres) par plateaux successifs jusqu’à 948 mètres en forêt de l’Annuelle, aux « Amaurandettes », soit un dénivelé de près de 600 mètres !
La commune nouvelle couvre une superficie de 30 km² et compte 2 600 habitants essentiellement regroupés au centre bourg et dans les villages de Ponthoux et Pratz. Quelques habitations sont localisées dans les hameaux de Brive d’Aval, Brive d’Amont et La Pratz, plus nombreuses dans les hameaux de Lizon, Saint-Romain, Champied et Petit-Châtel.